Identification of sunflower pathogenic fungus Plenodomus lindquistii using PCR with species-specific oligonucleotide primers

Аннотация

Plenodomus lindquistii – возбудитель фомоза подсолнечника (чёрной стеблевой пятнистости) – заболевания, которое широко распространено в России во всех регионах, возделывающих эту культуру. Диагностика этого заболевания, как в полевых, так и в лабораторных условиях весьма затруднительна. Одним из методов молекулярной диагностики фитопатогенных грибов является ПЦР с видоспецифичными праймерами. Такой метод позволяет проводить высокоточную детекцию и идентификацию целевых объектов. Цель данной работы заключалась в разработке видоспецифичных олигонуклеотидных праймеров, избирательно амплифицирующих ДНК гриба P. lindquistii. Праймеры LepliF2/LepliR2, разработанные на основе анализа ITS локуса, показали стабильную амплификацию ДНК целевого гриба при отсутствии кросс-реакции с другими видами грибов. Эти праймеры могут быть рекомендованы для проведения экспресс-диагностики возбудителя фомоза подсолнечника. Данная работа представляет собой первую разработку в области молекулярной экспресс-диагностики этого патогена.